Weiterhin werden die Perrons erhöht, um Personen mit eingeschränkter Mobilität oder Reisenden mit Kinderwagen einen stufenfreien Einstieg in die Züge zu ermöglichen. Die Zugangsrampen werden entsprechend angepasst. Nach den Arbeiten wird der Bahnhof die Anforderungen des Behindertengleichstellungsgesetzes erfüllen. In Absprache mit dem Verein Inclusion Handicap hat die SBB beschlossen, mit Blick auf die erwartete Zunahme des Reisendenaufkommens zusätzliche Lifte einzubauen, um allen Kundinnen und Kunden mehr Komfort zu bieten.

Schliesslich entsteht im Westteil des Bahnhofs eine zweite Unterführung zwischen der Esplanade de l’Ancienne Gare und der Richemond-Kreuzung. Auch hier baut die SBB stufenfreie Zugänge für Reisende mit eingeschränkter Mobilität. Diese neue Unterführung soll 2023 in Betrieb genommen werden. Die Kosten der Modernisierungsarbeiten am Bahnhof Freiburg belaufen sich auf knapp 110 Millionen Franken.

Die SBB ist darum bemüht, die Auswirkungen der Bauarbeiten auf die Anwohnerinnen und Anwohner sowie auf die Reisenden möglichst gering zu halten. Verschiedene im Frühling 2021 geplante Arbeiten erfordern aber einen Teilunterbruch des Bahnverkehrs an bestimmten Wochenenden. Die Fahrpläne werden entsprechend angepasst und frühzeitig kommuniziert.

Zusätzlich zu den Arbeiten an der Infrastruktur wird das Bahnhofgebäude, u.a. dessen Heizung, Lüftung, Technik und Wärmedämmung, totalsaniert. Während dieser Arbeiten zieht die Apotheke vorübergehend in Container vor dem Bahnhof. Die Arbeiten starteten am 6. April 2021 und dauern bis in den Sommer 2022. Die Apotheke bleibt bis Anfang 2022 am provisorischen Standort.