Die Schienen im 1975 eröffneten Heitersbergtunnel liegen nicht auf Schotter, sondern auf einbetonierten Schwellenblöcken. Nach knapp 40 Betriebsjahren hat diese feste Fahrbahn das Ende ihrer Lebensdauer erreicht; die Schwellen müssen ausgewechselt werden. Die Sanierung ist ein schweizweites Novum: Noch nie musste eine feste Fahrbahn in diesem Umfang instandgesetzt werden. Dabei ersetzt die SBB lediglich die Schienen und die Schwellen im 1975 eröffneten Tunnel. Die Gleistragplatte aus Beton ist in gutem Zustand und bleibt bestehen. Die Kosten betragen rund 20 Millionen Franken.
Im doppelspurigen Tunnel wird im ersten Quartal der Jahre 2014 und 2015 je ein Gleis in verlängerten Nachtsperren und an drei Wochenendsperren erneuert. Der Tunnel bleibt dabei einspurig befahrbar. 2014 wird das südliche Gleis saniert, 2015 das nördliche. Während des einspurigen Betriebs werden die Fernverkehrszüge von Olten teilweise via Baden und Brugg nach Zürich umgeleitet. Die Fahrzeiten ändern sich im Minutenbereich. Während den Wochenendsperren fallen einige Interregio-Züge aus. Der Online-Fahrplan ist entsprechend angepasst, in den Zügen und an den Bahnhöfen informiert die SBB die Reisenden mittels Durchsagen. Das Angebot der S-Bahnen bleibt unverändert. Allerdings verkehrt die S12 Brugg–Baden–Zürich vom 6. Januar bis am 13. März 2014 ab 22.04 Uhr bis Betriebsschluss drei Minuten früher.
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