Täglich benutzen 25 000 Reisende den Bahnhof Lenzburg. Aufgrund der Entwicklungen rund um den Bahnhof rechnet die SBB bis im Jahr 2040 mit einer Zunahme der Zahl der Ein- und Aussteigenden auf 40 000. Deshalb wird der Bahnhof Lenzburg in grossen Teilen neu gebaut.

Zentrale Elemente des Ausbaus sind die neuen Mittelperrons der Gleise 1/2 und 3/4. Die Erschliessung dieser Perrons findet über zwei neue Personenunterführungen «Ost» und «West» statt. Die Zugänge zu den Perrons werden über Rampen und Treppen ermöglicht. Zusätzlich wird die Projektierung so gestaltet, dass Lifte eingebaut werden können.

Im Süden werden durch ein Stadtentwicklungsprojekt von SBB Immobilien Kanton und Stadt der Bahnhofplatz und das Bahnhofsquartier neugestaltet. Für Reisende im Regionalverkehr in Richtung Nationalbahn, Freiamt und Seetal wird ein neues Perron mit den Gleisen 6-8 realisiert, das ebenfalls an die neuen Personenunterführungen angeschlossen wird. Die Seetalbahn wird neu in den Bahnhof Lenzburg eingebunden; die Reisenden müssen künftig nicht mehr die Bahnhofstrasse überqueren.